以驻地得名。 解放前夕分属赣县水西乡、永安乡、和乐乡。1949年9月隶属水西区。1950年设置龙岭、官田、梨园、横江、永安、石铺、和乐七乡，属湖边区。1952年10月分属湖边区湖乡、梨园乡、官田乡、坎子乡、横江乡、蛤湖乡、永安乡、和乐乡、黄沙乡及五云区石铺乡。1956年撤区并乡后、设置湖边乡、梨园乡、横江乡、永安乡、石铺乡、和乐乡、黄沙乡。1957年2月属湖边区，其中石铺乡并入和乐乡。1958年9月改为红旗公社湖边管理区。

1959年设立湖边、横江、和乐3个公社。1961年4月由赣县划属赣州市，分属湖边，水西、横江、和乐及八〇三公社。同年11月，划归赣县，属湖边区湖边、横江、和乐三个公社（其中划属水西公社的龙岭、杨梅、珠坑三大队仍属市水西公社）。1963年6月龙岭、杨梅、珠坑三大队划归赣县湖边区湖边公社。1965年6月撤湖边区，横江、湖边、和乐3个公社合并为湖边公社。1978年元月从赣县划属赣州市。

1984年4月改称湖边乡。1989年由湖边乡析置蛤湖[Hahu]乡。1997年，湖边乡面积49平方千米，人口2.7万，辖窑下、石灰山、官田、善边、岗边、涌泉、梨园、社前、湖边、龙岭、螺田11个行政村和湖边、赣州森林铁路管理处、赣州林业工程公司、赣南林区汽车修配厂、赣州有色冶金化工厂、江西省商业技工学校6个居委会，乡政府驻石公坑；蛤湖乡面积53平方千米，人口1万，辖上禾、窑背、永安、蛤湖、横江、?头、叶山、苏边8个行政村。

1998年8月5日，撤销湖边乡，设立湖边镇（赣民字[1998]126号批复）。2001年3月2日，撤销蛤湖乡，划归湖边镇（赣民字[2001]97号批复）。

镇内有两座小（一）型水库，即红旗水库、吉坑水库，总库容分别为769、135万立方米。至2005年上半年，基本实现村村通水泥硬化目标。全镇有邮政电信所1个，实现村村通电话。截止2005年上半年实现村级公路硬化里程达71.98公里。镇内企业以食品加工、炼钢、饮料、电力器材、制衣、打火机等生产为主，到2005年上半年，湖边镇共有镇村企业450个，其中产值达千万元以上企业9家，分别是赣州市东南制钢有限公司、赣州市电力设备有限公司、赣州市宏远电线有限公司、裕峰制衣有限公司、赣州市卫诚火机制造有限公司和赣州市芳英禽业食品有限公司、步阳置业、海信房地产、富升苑。

湖边镇主要农产品有水稻、蔬菜、芋头、板薯、生姜、油菜，农产品加工有板鸭、腊制食品、酱菜等。矿产有银、铜、钨、石灰石、陶土及建筑用石材等。

2004年，湖边镇工农业总产值达20229万元，乡镇企业总产值达13950万元，其中工业总产值13950万元，农业总产值6279万元；财政总收入903.7万元，地方财政收入529.24万元，农民人均纯收入2871元，比上年增加380元，经济势头发展良好。

2005年上半年，乡镇企业总产值达10152万元，其中工业总产值9368万元。财政总收入1—5月499.83万元、地方财政收入275.80万元。2004年农业总产值6279万元、农民人均纯收入2871元，比上年增加380元，经济势头发展良好。